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揭示身體之謎,這個研究院正在繪制全球最全人體大數據 |生產力新躍遷·策源之力
最后更新: 2024-05-26 18:03:31界面新聞記者 | 楊舒鴻吉
人類如何從胚胎發(fā)育成長,又因何患疾病、衰老、死亡?
近年來,國際生命科學界對被譽為“人體大數據”人類表型組愈加關注。“人類表型組”已被視為后基因組時代的新科學制高點,其研究成果將推動生命科學進入新的發(fā)展階段。
所謂“人類表型組計劃”就是全面、系統(tǒng)地測量和研究人類各種可測量的生理、生化和行為特征,借助先進的測量技術和大數據分析方法,探討這些表型與人類健康、疾病及其遺傳的關系。
以復旦大學為代表的中國科學界,自2014年起就開始在“測一切之可測”的理念指導下,積極籌備并引領國際科學界共同發(fā)起“人類表型組國際大科學計劃”。經過多年努力,這一國際大科學計劃已經進入了快速推進階段。
5月22日上午,由上海市委網信辦、上海市科技工作黨委聯(lián)合主辦的“策源之力”媒體行走訪上海國際人類表型組研究院和張江復旦國際創(chuàng)新中心。界面新聞獲悉,在該創(chuàng)新中心,我國已組織1000多組人類表型數據的系統(tǒng)采集。因此產生的大數據將對疾病治療、健康管理等領域產生重大影響。
為什么有約36%的東亞人喝酒會臉紅?
復旦大學人類表型組研究院副院長陶韡爍解釋稱,表型組研究發(fā)現(xiàn),宏觀表型為喝酒臉紅,背后的原因就是微觀表型乙醛脫氫酶2的失活,而對于精準健康的管理意義在于“喝酒臉紅”的人群易患食道癌、高血壓等疾病,并且對舌下含服硝酸甘油不敏感。
普通人中有一種現(xiàn)象叫“斷掌”,即手掌紋路橫貫整個掌心。表型組大數據研究顯示,斷掌(即手掌紋路橫貫整個掌心)與唐氏綜合征(21-三體綜合征)之間存在一定的關聯(lián)。
這一關聯(lián)就源自人類表型組研究過程中一個大數據。
2022年,中科院上海營養(yǎng)與健康研究所汪思佳研究員團隊,愛丁堡大學Denis Headon教授團隊和中科院院士、復旦大學校長、人類表型組研究院院長金力教授團隊聯(lián)合國內外十余家科研機構,在國際頂尖期刊《細胞》(Cell)雜志發(fā)表論文《肢體發(fā)育基因構成人類指紋花紋差異的基礎》。
圖片來源:上海國際人類表型組研究院和張江復旦國際創(chuàng)新中心
該論文首次發(fā)現(xiàn)與指紋相關的基因顯著富集在肢體發(fā)育與形成的相關通路而非皮膚發(fā)育相關通路,明確了人類肢體發(fā)育相關基因,在指紋花紋表型的形成中發(fā)揮了關鍵作用。這一關鍵發(fā)現(xiàn),為膚紋與人體其它表型,尤其是疾病易感性的關聯(lián)研究提供了重要理論基礎,有望成為解析宏觀與微觀表型關聯(lián)的經典范例。
團隊還尋找了美國、英國、澳大利亞的多家合作伙伴,對全球范圍內已有的東亞血統(tǒng)隊列和歐洲血統(tǒng)隊列,超過23,000個個體進行大規(guī)模薈萃分析,分析了幾百萬個遺傳點位,識別出43個與人類指紋花紋相關的遺傳基因座,105個顯著基因。
這一研究將為表型與疾病的關聯(lián)研究提供重要理論基礎,有助于繪就生命科學研究的下一代“導航圖”。
記者在該創(chuàng)新中心看到,共有9大類相關表型數據采集,“可以理解為一場最為復雜的身體體檢?!比祟惐硇徒M計劃人體精密測量中心主任、復旦大學人類表型組研究院教授羅競春說,“中心全年無休對志愿者進行表型組數據采集。”
當前生命科學研究主要集中在基因組和分子水平,而人類表型組研究則能夠實現(xiàn)從微觀到宏觀的全方位認知,為構建全新的生命科學范式提供重要支撐。
經過多年的共同努力,我國人類表型組國際大科學計劃在多個關鍵領域取得了重要進展。
金力院士團隊建成了全球首個跨尺度多維度人類表型精密測量平臺,能夠對個體從分子到生理、行為等多層面的表型特征進行全面精準測量,為后續(xù)研究奠定了堅實基礎。
金力院士團隊開發(fā)了全球首個人類表型組數據處理云平臺,并繪制了全球首張人類表型組參比導航圖譜,為后續(xù)大規(guī)模表型數據的采集、整合與分析提供了關鍵支撐。
圖片來源:圖片來源:上海國際人類表型組研究院和張江復旦國際創(chuàng)新中心
此外,在國際規(guī)范和標準制定方面取得重要突破。在復旦大學等團隊的推動下,相關國際標準如”基因組信息學-高通量基因表達數據可靠性評估”等已經正式發(fā)布,為人類表型組數據的可靠性和應用奠定了基礎。
全球表型組研究有望使用“上海標準”。
通過IHPC和HPCC兩大協(xié)作組的建立,來自20個國家的23位頂級科學家聚集在一起,共同推動人類表型組計劃的實施。同時,上海國際人類表型組研究院團隊還牽頭成立了“一帶一路”人類表型組聯(lián)合研究中心,拓展了國際合作的廣度和深度。
人類表型組研究成果將為精準醫(yī)療提供新的突破口。通過全面測量和分析個體的生理、生化和行為特征,人類表型組研究能夠更精確地預測個體的健康風險和疾病傾向,為個性化診療和健康管理提供科學依據。這將使得醫(yī)療服務向更加精準、個體化的方向發(fā)展,提高醫(yī)療效果,降低醫(yī)療成本。陶韡爍說。
標簽 上海- 原標題:揭示身體之謎,這個研究院正在繪制全球最全人體大數據 |生產力新躍遷·策源之力
- 責任編輯: 張致遠 
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