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提供達(dá)40倍加速計算，英特爾聯(lián)想幫助華大處理測序儀高通量數(shù)據(jù)
最后更新: 2020-03-03 14:10:48（文/觀察者網(wǎng) 一鳴）3月3日， 聯(lián)想集團(tuán)微信公眾號發(fā)布消息，該公司與英特爾、華大基因正攜手加快COVID-19新型冠狀病毒的基因組特性分析。
文章稱，英特爾、聯(lián)想提供的技術(shù)包括一個大型高性能計算集群，可用于處理從華大DNBSEQ-T7測序系統(tǒng)讀取的高通量數(shù)據(jù)。借此，華大基因?qū)⒓铀賹π滦凸跔畈《镜幕蚪M特性研究。
華大DNBSEQ-T7測序儀 圖片來源：華大基因
該技術(shù)將支持科學(xué)家研究病毒的毒性、傳播模式等，幫助流行病學(xué)及疫苗設(shè)計研究。
聯(lián)想方面稱：“通過這項合作，華大基因?qū)⒌靡岳^續(xù)優(yōu)化其新型冠狀病毒檢測試劑盒并獲取大量有價值的信息。這些信息將有助于確定將來開發(fā)有效疫苗或治療方法的潛在靶標(biāo)?！?
“通過英特爾和聯(lián)想的共同努力，聯(lián)想的超算技術(shù)支持并優(yōu)化了‘基因組優(yōu)化和可擴(kuò)展性工具’，可為全基因組測序和全外顯子測序的計算提供高達(dá)40倍的加速，助力華大基因優(yōu)化計算過程，高效處理數(shù)據(jù)，更快地生成可靠的基因組分析成果，從而縮短科研和臨床觀察的時間?！痹摴狙a(bǔ)充道。
據(jù)了解，在基因測序工作中，每毫升體液通常會包含數(shù)百萬個不同的病毒體，而每個病毒體的基因組則包含大約30000個DNA堿基或字母。
華大基因正在對許多感染患者和疑似感染患者的微生物進(jìn)行基因測序，因此這些研究工作將會生成TB級乃至PB級的海量數(shù)據(jù)。要想高效地快速處理這些重要數(shù)據(jù)，就需要采用更為先進(jìn)的HPC基礎(chǔ)架構(gòu)、計算技術(shù)以及優(yōu)化的基因組分析方法。
實驗人員操作DNBSEQ-T7測序儀 圖片來源：華大基因
“目前我們對這個新型冠狀病毒還有很多不了解的地方。華大基因通過分析病毒基因組數(shù)據(jù)，加速對感染者的快速識別和基因組特性的研究，而這些工作需要投入巨大的計算資源，這恰恰是我們可以發(fā)揮作用的地方。”英特爾公司市場營銷集團(tuán)副總裁兼中國區(qū)總經(jīng)理王銳表示。
聯(lián)想集團(tuán)高級副總裁、企業(yè)科技集團(tuán)總裁童夫堯則指出：“來自英特爾及聯(lián)想的大數(shù)據(jù)分析和健康與生命科學(xué)方面的專家，將整合我們的資源及專業(yè)技術(shù)，幫助解決目前面臨的嚴(yán)峻挑戰(zhàn)，推動健康和生命科學(xué)的發(fā)展進(jìn)程?！?
本文系觀察者網(wǎng)獨(dú)家稿件，未經(jīng)授權(quán)，不得轉(zhuǎn)載。
標(biāo)簽 聯(lián)想- 責(zé)任編輯: 一鳴
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