-
最大規(guī)模中國(guó)人基因庫(kù)研究結(jié)果首次發(fā)表,漢族可分成7個(gè)亞群
最大規(guī)模中國(guó)人基因庫(kù)研究結(jié)果首次發(fā)表。
4月30日,瑞金醫(yī)院內(nèi)分泌科領(lǐng)銜的ChinaMAP(中國(guó)代謝解析計(jì)劃)聯(lián)盟攜全國(guó)29家研究機(jī)構(gòu)和醫(yī)院,在中科院上海生命科學(xué)研究院主辦的《Cell Research》雜志首次報(bào)道了對(duì)覆蓋全國(guó)27個(gè)省份和直轄市,8個(gè)民族,超過(guò)1萬(wàn)人的高深度全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)和表型的系統(tǒng)性分析。
研究團(tuán)隊(duì)對(duì)隊(duì)列中代表中國(guó)不同地區(qū)和民族的10588人DNA樣本進(jìn)行了40×深度全基因組測(cè)序,完成了高質(zhì)量的中國(guó)人群遺傳變異數(shù)據(jù)構(gòu)建、中國(guó)人群體結(jié)構(gòu)分析、基因組特征比較以及變異頻譜和致病性變異解析。
此次發(fā)表意味著,通過(guò)中國(guó)人自己的儀器、平臺(tái)、分析方法,對(duì)中國(guó)人的基因組特征進(jìn)行深入、廣泛的研究,具有前所未有的重要意義。
日本人群與中國(guó)北方漢族人群聚類完全重疊
為什么有些人喝酒臉紅,為什么有些人更容易患癌?其實(shí),這些都與體內(nèi)某些特定基因有關(guān)。
長(zhǎng)期以來(lái),中國(guó)人的很多遺傳疾病研究,都直接應(yīng)用外國(guó)人的數(shù)據(jù)和結(jié)論。但由于不同地域人群和種族之間的歷史淵源和遺傳背景存在著巨大差異,如果把具有其他人群偏向性的知識(shí)和結(jié)論,直接拿來(lái)做為中國(guó)人的疾病風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估、遺傳咨詢或診斷治療依據(jù),并不完善、可靠。
國(guó)家代謝性疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心(上海)基于瑞金醫(yī)院牽頭開展的多項(xiàng)覆蓋全國(guó)的隊(duì)列研究,依托轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)國(guó)家重大科技基礎(chǔ)設(shè)施(上海)和醫(yī)學(xué)基因組學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,實(shí)施了中國(guó)代謝解析計(jì)劃ChinaMAP (China Metabolic Analytics Project)。
本文圖片均為“上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院”微信公眾號(hào) 圖
研究覆蓋中國(guó)七大地理區(qū)域,包括了人口排名前十的漢族、壯族、回族、滿族、苗族、彝族、藏族和蒙古族,顯示了中華民族跨地理區(qū)域人群遺傳背景的多樣性和復(fù)雜性。
研究團(tuán)隊(duì)首次揭示了漢族人群可顯著分成7個(gè)亞群:北方漢族、西北漢族、東部漢族、中部漢族、南方漢族、東南漢族、和嶺南漢族。
少數(shù)民族中,藏族、彝族、蒙古族、苗族和壯族都有著獨(dú)特的人群聚類,而滿族和北方漢族相近,回族和西北、北方漢族相近。不同地域人群的變異特征也與中國(guó)歷史上的人口遷徙和變遷相關(guān),例如河西走廊是絲綢之路中不同民族遷徙的交通要道,歷史上包括粟特人等許多民族曾在此經(jīng)商生活。
瑞金醫(yī)院內(nèi)分泌科主任王衛(wèi)慶教授介紹,研究團(tuán)隊(duì)對(duì)隊(duì)列中代表中國(guó)不同地區(qū)和民族的10588人DNA樣本進(jìn)行了40×深度全基因組測(cè)序,完成了高質(zhì)量的中國(guó)人群遺傳變異數(shù)據(jù)構(gòu)建、中國(guó)人群體結(jié)構(gòu)分析、基因組特征比較以及變異頻譜和致病性變異解析。在ChinaMAP一期數(shù)據(jù)庫(kù)中,包含1.36億個(gè)基因多態(tài)性位點(diǎn)SNP和1千萬(wàn)個(gè)插入或缺失位點(diǎn)(NDEL),其中一半是在國(guó)際通用的多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中均沒有的新位點(diǎn)。
不少遺傳性疾病是寫在基因密碼中的。疾病相關(guān)變異位點(diǎn)在中國(guó)人群與歐美人群中的頻率存在差異,因此,中國(guó)的遺傳咨詢和解讀,對(duì)重要性不確定的基因變異(VUS)的研究,以及相關(guān)臨床指南和路徑制定,需要依據(jù)中國(guó)人自己的大樣本和高質(zhì)量數(shù)據(jù)。
研究揭示,現(xiàn)代河西走廊地區(qū)的人們具有的基因多態(tài)性位點(diǎn)數(shù)量更多更復(fù)雜。與全世界其他人群相比,中國(guó)人的遺傳特征與歐洲、非洲、南亞和拉丁美洲人群之間存在著巨大差異,與非洲人群差距最大,而與東亞人群非常相似。研究者在成分分析中發(fā)現(xiàn),日本人群與中國(guó)北方漢族人群聚類完全重疊。
山東人酒量并不突出
ChinaMAP對(duì)中國(guó)人的營(yíng)養(yǎng)代謝和藥物代謝相關(guān)遺傳特征也進(jìn)行了分析比較。
對(duì)受到廣泛關(guān)注的酒精代謝能力,從總體上看,北方人比南方人酒量相對(duì)更好,藏族、蒙古族、彝族人民和河南人酒量居于全國(guó)前列,山東人酒量并不突出,福建人和廣東人排在最后。
ChinaMAP證實(shí),導(dǎo)致喝酒臉紅和酒精代謝能力差的乙醛脫氫酶2基因rs671變異是東亞人特異性的,在中國(guó)人群中的攜帶者(純合子比例4.50%,雜合子比例34.27%)遠(yuǎn)高于全球其他人群。rs671變異也是誘發(fā)食管癌發(fā)生的重要風(fēng)險(xiǎn)因素,所以喝酒臉紅應(yīng)少喝酒。
代謝性疾病,特別是Ⅱ型糖尿病和肥胖,已成為中國(guó)和世界范圍內(nèi)發(fā)病率最高的重大慢病。但是,歐洲人群中最顯著的Ⅱ型糖尿病遺傳風(fēng)險(xiǎn)TCF7L2基因變異(如rs7903146)在中國(guó)人中的頻率卻很低,可見在代謝特征和疾病研究中,僅參考和驗(yàn)證歐美人群的結(jié)果是不行的。
另外,一個(gè)人攜帶的某個(gè)基因變異產(chǎn)生的疾病風(fēng)險(xiǎn)可能并不大,但綜合多個(gè)基因變異的作用后對(duì)個(gè)體特征有重大影響。因此,基于特定人群的大規(guī)?;蛐秃捅硇蛿?shù)據(jù)庫(kù),通過(guò)多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分(PRS)評(píng)估個(gè)體的疾病風(fēng)險(xiǎn)是一種比較準(zhǔn)確的方法。
在ChinaMAP研究中,研究者對(duì)Ⅱ型糖尿病遺傳風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行了多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分,以量化評(píng)分、年齡和血糖值的排序三維顯示了每個(gè)人在整個(gè)群體中的精確位置。多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分排名顯示了Ⅱ型糖尿病高風(fēng)險(xiǎn)和低風(fēng)險(xiǎn)的個(gè)體之間存在非常顯著的血糖差異,高風(fēng)險(xiǎn)個(gè)體隨著年齡的增加,空腹和餐后2小時(shí)血糖都顯著高于中風(fēng)險(xiǎn)和低風(fēng)險(xiǎn)者。
此外對(duì)比證實(shí),基于東亞人群的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)比基于歐洲人群的數(shù)據(jù)結(jié)果更加準(zhǔn)確。這些結(jié)果提示,基于中國(guó)人群基礎(chǔ)數(shù)據(jù)對(duì)Ⅱ型糖尿病及其他代謝性疾病進(jìn)行精確風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的重要性,對(duì)重大慢病的預(yù)防、個(gè)體化健康管理和公共衛(wèi)生決策具有價(jià)值。
綜上所述,ChinaMAP以覆蓋中國(guó)各地區(qū)的研究隊(duì)列為基礎(chǔ)建立了高質(zhì)量中國(guó)人群數(shù)據(jù)庫(kù),通過(guò)高深度全基因組數(shù)據(jù)和精細(xì)表型分析,可為疾病機(jī)制研究、預(yù)防、遺傳咨詢和公共衛(wèi)生管理提供依據(jù)。
- 原標(biāo)題:最大規(guī)模中國(guó)人基因庫(kù)研究結(jié)果首次發(fā)表,漢族可分成7個(gè)亞群
- 責(zé)任編輯: 李天宇 
-
新聞多一點(diǎn) | 習(xí)近平來(lái)到云岡石窟
2020-05-11 22:03 新時(shí)代新氣象新作為 -
習(xí)近平山西行丨首站來(lái)到大同西坪鎮(zhèn)
2020-05-11 22:01 新時(shí)代新氣象新作為 -
習(xí)近平山西行丨走進(jìn)大同云岡石窟
2020-05-11 21:50 新時(shí)代新氣象新作為 -
習(xí)近平考察的黃花產(chǎn)業(yè),如何助力脫貧攻堅(jiān)
2020-05-11 21:49 新時(shí)代新氣象新作為 -
習(xí)近平赴山西考察調(diào)研
2020-05-11 21:06 -
國(guó)家衛(wèi)健委:加強(qiáng)實(shí)驗(yàn)室生物安全監(jiān)管
2020-05-11 20:56 新冠肺炎抗疫戰(zhàn) -
中國(guó)向新西蘭提出嚴(yán)正交涉
2020-05-11 19:45 臺(tái)灣 -
豐巢超時(shí)收費(fèi)引發(fā)普遍不滿,上海消保委表態(tài)
2020-05-11 19:20 -
北京衛(wèi)健委:小湯山醫(yī)院準(zhǔn)備建立大型實(shí)驗(yàn)室
2020-05-11 18:06 新冠肺炎抗疫戰(zhàn) -
國(guó)民黨即將提出兩岸新論述,保留“九二共識(shí)”
2020-05-11 17:11 臺(tái)灣 -
任正非接受港媒采訪:我們一直在做6G,與5G同步
2020-05-11 17:03 華為 -
精準(zhǔn)抓防控 堅(jiān)定促發(fā)展
2020-05-11 16:26 新冠肺炎抗疫戰(zhàn) -
習(xí)近平談防災(zāi)減災(zāi):從源頭上防范 把問(wèn)題解決在萌芽之時(shí)
2020-05-11 16:21 全國(guó)防災(zāi)減災(zāi)日 -
-
陜西原書記趙正永被控受賄超7億,當(dāng)庭認(rèn)罪悔罪
2020-05-11 15:51 廉政風(fēng)暴 -
因“截口罩”被問(wèn)責(zé)的大理州州長(zhǎng),履新了
2020-05-11 15:22 -
香港有人縱火鬧事,反對(duì)派立法會(huì)議員鄺俊宇被拘捕
2020-05-11 15:21 香港 -
口罩下的迪士尼,見證滿血活力的上海
2020-05-11 14:43 新冠肺炎抗疫戰(zhàn) -
疫情期間偷越國(guó)境賭博,福建兩名男子被判刑
2020-05-11 14:16 -
舒蘭市長(zhǎng):全面進(jìn)入戰(zhàn)時(shí)狀態(tài),將開展入戶大排查
2020-05-11 14:08 新冠肺炎抗疫戰(zhàn)
相關(guān)推薦 -
“美國(guó)政府像青少年,拿信用卡揮霍,直到…” 評(píng)論 52“聽到東方驚雷了嗎?那是14億中國(guó)人在笑話美國(guó)” 評(píng)論 195美國(guó)解除對(duì)華C919發(fā)動(dòng)機(jī)出口禁令 評(píng)論 395“沒客戶!”獲47億補(bǔ)貼后,三星在美芯片廠推遲投產(chǎn) 評(píng)論 89最新聞 Hot
-
“美國(guó)政府像青少年,拿信用卡揮霍,直到…”
-
“聽到東方驚雷了嗎?那是14億中國(guó)人在笑話美國(guó)”
-
“以色列和俄羅斯正進(jìn)行秘密會(huì)談”
-
“不同于西方,中國(guó)正建設(shè)由技術(shù)驅(qū)動(dòng)的福利模式”
-
中國(guó)駐泰國(guó)大使館:被騙至緬甸的男模特已獲救
-
“越南在走鋼絲,稍有不慎,就會(huì)惹惱中國(guó)”
-
最新民調(diào):4成支持馬斯克成立新政黨
-
美伊下周在挪威談?
-
“俄美有興趣共同實(shí)施經(jīng)濟(jì)領(lǐng)域一些‘有前景的項(xiàng)目’,特別是能源”
-
人才引進(jìn)被舉報(bào)中止1年后,再招考入圍名單與此前一致?包頭通報(bào)
-
特朗普威脅:周五,接關(guān)稅吧
-
“歐洲領(lǐng)導(dǎo)人向我求助,我提了建議”
-
“我簽署時(shí)候,B-2、F-22將從頭頂飛過(guò)”
-
天文學(xué)家發(fā)現(xiàn)第三個(gè)進(jìn)入太陽(yáng)系的“星際訪客”
-
馮德萊恩承認(rèn):來(lái)不及談成,退而求其次…
-
特朗普簽署行政令:外國(guó)游客得加錢
快訊- 打虎!馮志斌被查
- 字節(jié)跳動(dòng)新加坡員工食物中毒案:云海肴CEO認(rèn)罪,問(wèn)題雞丁病菌超標(biāo)2000倍
- 網(wǎng)傳美團(tuán)秘密籌備“快樂猴”硬折扣超市,對(duì)標(biāo)盒馬NB
- 佩通坦基本盤還穩(wěn)嗎?泰國(guó)權(quán)力天平傾向何方
- 《“全球南方傳媒聯(lián)合體”倡議書》全文
- 影石Insta360攜手寶馬發(fā)布X5聯(lián)名款全景相機(jī),摩托車全生態(tài)即將全面更新
- 時(shí)隔兩年,iPhone在華銷量再現(xiàn)季度增長(zhǎng)
- 中國(guó)首款GLP-1減重藥物瑪仕度肽,于美團(tuán)線上首發(fā)
-