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1929年10月，隨著北京冬天的到來，周口店遺址當(dāng)年的發(fā)掘工作即將進(jìn)入尾聲。截至10月中旬，研究人員在80英尺的垂直面上，已經(jīng)在4個不同的堆積層中發(fā)現(xiàn)了中國猿人的牙齒和破碎骨片。剛從北大地質(zhì)系畢業(yè)、擔(dān)任新生代研究室的技師裴文中向上級要求“可以再干上一兩個星期”，他的上級做出了讓步；沒想到，12月2日，裴文中從周口店第1地點(diǎn)發(fā)掘出了一個完整的頭蓋骨。經(jīng)步達(dá)生和德日進(jìn)鑒定，這是一個北京猿人的頭蓋骨，且其在形態(tài)上比1924年在東非發(fā)現(xiàn)的南方古猿更接近人類。而且，周口店遺址除了“北京猿人”的人骨遺存外，還伴隨出土了大量加工石器和用火遺跡。這一發(fā)現(xiàn)轟動了世界：這是最早被認(rèn)定能制作工具和用火的遠(yuǎn)古人類，且直立人這一重要的人類演化階段因其而確立。

除此以外，“北京猿人”的重要性還在于，他出土的周口店遺址擁有遠(yuǎn)不止一個時期的人類遺存：周口店第4地點(diǎn)出土的早期智人化石，龍骨山頂部山洞出土的山頂洞人則是晚期智人的代表之一，一條從“直立人”到“早期智人”、再到“晚期智人”的完整人類發(fā)展脈絡(luò)在此展開。

1929年，裴文中抱著加固后的頭蓋骨。

因此，自20世紀(jì)30年代以來，很多專家深信“北京猿人”就是中國人的祖先。比如，1934年步達(dá)生因病去世后，接替他工作的德國猶太裔人類學(xué)家魏敦瑞（Franz Weidenreich）就提出了“連續(xù)進(jìn)化附帶雜交”的假說。這種假說認(rèn)為，中國的古人類是連續(xù)進(jìn)化的，并且進(jìn)化出了共同的特征，比如北京猿人就與現(xiàn)代中國人有一些共同的特征：頭骨正中央的矢狀隆起、下頜圓枕、鏟形門齒等。

這種理論的影響極大，直到20世紀(jì)80年代分子生物學(xué)對其提出了挑戰(zhàn)。由于DNA研究技術(shù)的突破，分子生物學(xué)迎來巨大進(jìn)展。1987年，夏威夷大學(xué)的坎恩（Rebecca  Cann）以及加州大學(xué)伯克利分校的斯托金（Mark Stoneking），宣布了一項驚人發(fā)現(xiàn)：在對全球147例個體樣本的線粒體遺傳物質(zhì)（mitochondria DNA，簡寫為mtDNA）進(jìn)行分析后，發(fā)現(xiàn)所有樣本均屬于非洲特有樣本類群的衍生支系。也就是說，就母系而言，各個區(qū)域的現(xiàn)代人并不是由同一區(qū)域的直立人進(jìn)化而來，而是散布到全世界的非洲現(xiàn)代智人的后裔。

這一驚人發(fā)現(xiàn)的關(guān)鍵在于線粒體DNA的特性：它只通過母系遺傳，父系線粒體DNA對下一代完全沒有影響。因此，線粒體DNA的類型不會因繁殖而產(chǎn)生改變。一個族群的每一代總有些女性不育或者沒有女性后代，其線粒體DNA的形態(tài)因而失傳。經(jīng)過許多代之后，這種偶然性的淘汰就會只留下一種線粒體DNA類型——也就是說，整個族群后裔的線粒體DNA都與原族群某個“幸運(yùn)”的女性同型。反過來說，就線粒體DNA的遺傳而言，則作為后裔的每一族群必然有一位“共同的祖母”即“夏娃”存在。這一特性使得它在追溯母系血統(tǒng)和研究人類遷徙歷史時具有獨(dú)特的優(yōu)勢。

另外，線粒體DNA數(shù)量龐大，它在古代DNA提取中表現(xiàn)出了較高的穩(wěn)定性，成為從化石或古代遺骸中獲取遺傳信息的首選目標(biāo)。1997年，德國馬克斯·普朗克研究所的研究人員從尼安德特人骨骼中成功提取出線粒體DNA，而現(xiàn)代人身上并沒有這種線粒體DNA，因此現(xiàn)代人類并非從尼安德特人中演化而來。

中國科學(xué)院昆明動物研究所孔慶鵬研究員從2003年起，先后系統(tǒng)地分析了數(shù)千個東亞個體的線粒體DNA基因組序列數(shù)據(jù)，結(jié)果揭示東亞所有已鑒定的母系世系均源于非洲，未發(fā)現(xiàn)任何源自中國本土直立人的母系遺傳貢獻(xiàn)。

進(jìn)入21世紀(jì)后，分子生物學(xué)對Y染色體DNA研究的逐步深入，這也為“走出非洲假說”提供了新的有力證據(jù)。人類Y染色體DNA大小是線粒體的三千多倍，蘊(yùn)含著更豐富的群體遺傳信息。另外，Y染色體的結(jié)構(gòu)也很有特點(diǎn)，它由擬常染色體區(qū)和雄性特異區(qū)組成，其中雄性特異區(qū)不與同組染色體發(fā)生重組，被稱為非重組區(qū)，在父系遺傳中能很好地記錄傳代過程中所產(chǎn)生的突變。同時，Ｙ染色體理論上的有效群體大小是常染色體的四分之一，對群體的遺傳漂變事件非常敏感，能夠提供更加豐富的群體歷史信息。

直立人從非洲向歐洲大陸擴(kuò)散的主要路徑和時間 取自吳秀杰《中國發(fā)現(xiàn)的主要直立人頭骨化石》（2019年）一文

根據(jù)Y染色體的這些特點(diǎn)，美國斯坦福大學(xué)的研究者于2000年就繪制出了比較完整的全世界人群Y-DNA系統(tǒng)發(fā)育樹，再次將人類的祖先追溯到了非洲，并推測出了現(xiàn)代人大致的遷徙路線。中國學(xué)者對現(xiàn)代東亞人群的遺傳物質(zhì)檢驗證明了這一理論。

1999年，中國科學(xué)院昆明動物研究所宿兵研究員檢測了東亞人群樣本中Y染色體非重組區(qū)的19個遺傳標(biāo)記，認(rèn)為東亞地區(qū)現(xiàn)代人起源于非洲，并從南方進(jìn)入東亞，而后向北遷徙。2000年，復(fù)旦大學(xué)的金力教授團(tuán)隊擴(kuò)大了采樣范圍，對東亞地區(qū)的12127份男性隨機(jī)樣本的Y染色體進(jìn)行遺傳標(biāo)記分型研究。這些樣本包括了所有的語系、大部分民族，甚至偏遠(yuǎn)地區(qū)的隔離群體，證明了從父系遺傳來看，現(xiàn)存東亞人群都是走出非洲的現(xiàn)代人的后裔。

盡管DNA研究“人類起源”的證據(jù)看上去“板上釘釘”，但“走出非洲假說”也面臨著很多問題。其中最重要的是，這種假說無法解釋東亞地區(qū)出土的大量古人類化石，且基本是連續(xù)發(fā)展進(jìn)化的，如果現(xiàn)代東亞人完全來自非洲，那么這些“本土”的晚期智人何去何從？他們被徹底滅絕了嗎？

另外，由于在推算現(xiàn)代人何時走出非洲的時間上，采用的校準(zhǔn)工具不同，會產(chǎn)生較大誤差。一般推測現(xiàn)代人是在10萬年前走出非洲的，但是世界多地已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了早于10萬年的現(xiàn)代人化石，如何解釋這中間的時間差？這些都還需要更多的分子遺傳學(xué)證據(jù)來證明。

人類演化關(guān)鍵階段 （https://shire.science.uq.edu.au/showcase/evolution/，中國科學(xué)院古脊椎動物與古人類研究所邢松研究員翻譯）

德日進(jìn)無從知道21世紀(jì)分子生物學(xué)對研究“人類起源”問題的方向性修正，但這一終極問題確實促使他形成了自己的哲學(xué)思想。早在1926年10月15日，他就寫道：“在學(xué)術(shù)上，我一直對地質(zhì)學(xué)上的技術(shù)研究感到有趣，因為在地質(zhì)學(xué)上還有許多等待解決的問題。但是，特別在這一兩年來，我卻逐漸把史前史的研究轉(zhuǎn)到現(xiàn)代人性的問題上來。我逐漸發(fā)展出一個頗為清晰的念頭，認(rèn)為人乃是大地現(xiàn)象的極致，他就是地質(zhì)過程和偉大生命之流的巔峰。換句話說，我發(fā)現(xiàn)了地質(zhì)學(xué)的人性發(fā)展……”

1938年，德日進(jìn)在此基礎(chǔ)上開始撰寫他最有名的作品《人的現(xiàn)象》。在這本書中，他試圖從地質(zhì)學(xué)發(fā)現(xiàn)出發(fā)，大膽提出關(guān)于宇宙、生物、人類、精神逐層進(jìn)化的論點(diǎn)，近而發(fā)展出一整套基于進(jìn)化論的宇宙觀和人類觀。1941年，他將此書稿投給了羅馬的機(jī)構(gòu)出版，希望教會能認(rèn)可其觀點(diǎn)，但遭到了拒絕，教會拒絕此書出版。1946年，德日進(jìn)從中國回到法國，迎接他的不是祖國學(xué)術(shù)界的熱烈歡迎，而是失業(yè)的危機(jī)。

作為耶穌會會士，德日進(jìn)在古生物學(xué)中獲得的成就，以及他在《人的現(xiàn)象》中表現(xiàn)出來的“進(jìn)化論”的哲學(xué)思想，被教會高層認(rèn)為是危險的，因此希望他不再從事相關(guān)研究和教學(xué)工作。為了獲得更寬松的學(xué)術(shù)環(huán)境，德日進(jìn)決定前往美國。1951年，他移居美國，繼續(xù)自己的研究。1955年，德日進(jìn)去世；同年，《人的現(xiàn)象》一書終于獲準(zhǔn)出版。

英國生物學(xué)家赫胥黎在《人的現(xiàn)象》英譯版的前言中寫道：“我們?nèi)祟?，包含了地球無垠的前程”，探索人類，就是在了解“這無垠的前程”，而德日進(jìn)的貢獻(xiàn)，就在于他用“知識和仁愛”讓人們增加了對這一“前程”的了解，這就是對“人的現(xiàn)象”的升華。

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