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15秒完成一次CT圖像診斷 “天河二號”超級計算機搭建CT影像智能診斷平臺
為了方便其他科研團(tuán)隊的后續(xù)研究,謝偉東還立即聯(lián)系全球多地藥物供應(yīng)商,花了2周時間,完成所有潛在藥物化合物的采購,免費提供給下一個團(tuán)隊開展病毒抑制試驗。目前藥效正在進(jìn)一步驗證中。
“疫情暴發(fā)后,我相信全世界的科學(xué)家們,都在為治療新冠肺炎做著三件事:新藥研發(fā)、老藥新用、研制疫苗。這是身為科學(xué)家的責(zé)任?!敝x偉東說,“我大年初九從加拿大回來時,所有人都叫我不要回來,飛機幾乎是空的。但我一定要回來,這是一場戰(zhàn)斗,我們責(zé)無旁貸。”
制藥:目前已篩選出一批化合物
但特效藥還沒有誕生,戰(zhàn)斗還沒有結(jié)束。謝偉東告訴記者,智睿醫(yī)藥正依托集合了近一億個化合物的3D結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫,通過“天河二號”超級計算機開展化合物的挖掘。目前已篩選出一批化合物,完成采購后將聯(lián)合P3實驗室開展病毒抑制實驗。但新藥研發(fā)并不容易,它需要嚴(yán)格、復(fù)雜的步驟和大量的投入,最快也需要2到3年時間。
“所幸,人類現(xiàn)在有超算、人工智能、大數(shù)據(jù)這些科技力量,縮短了新藥研發(fā)的時間?!敝x偉東說,“我是廣州人,也是中大人。我很自豪,在廣州、在中大,有‘天河二號’這樣的超級計算機。在這場戰(zhàn)‘疫’中,它是科學(xué)家手中強大的武器?!?
分析:定點醫(yī)院療效數(shù)據(jù)在線分析
對疫情的防控也離不開大數(shù)據(jù)的測算與助力。當(dāng)前,廣州超算正在助力全國戰(zhàn)“疫”。
昨日,超算中心負(fù)責(zé)人向記者介紹,通過與國家衛(wèi)健委及其所屬機構(gòu)的合作,超算中心部署了國務(wù)院醫(yī)療救助組新冠肺炎病例醫(yī)療質(zhì)控系統(tǒng)。“我們利用已有健康醫(yī)療平臺的優(yōu)勢基礎(chǔ),緊急研發(fā)部署了基于超算的抗新冠病毒疫情信息系統(tǒng)和數(shù)據(jù)庫,實現(xiàn)定點醫(yī)院全部病例數(shù)據(jù)和臨床藥物療效數(shù)據(jù)的實時采集與在線分析,實現(xiàn)抗疫醫(yī)療質(zhì)量控制與分析?!?
在阻斷疫情擴(kuò)散方面,廣州超算中心也發(fā)揮了重要作用。該負(fù)責(zé)人介紹,從大年三十開始,廣州超算中心的科研團(tuán)隊就參與啟動了“疫情蹤”軟件的研發(fā)工作。這個軟件基于已確診的病患,利用傳統(tǒng)流行病調(diào)查與大數(shù)據(jù)追蹤分析等手段,結(jié)合地理信息技術(shù),構(gòu)建了新冠病毒肺炎病患時空軌跡數(shù)據(jù)庫。
“軟件可以每5-10分鐘采集一次用戶的軌跡數(shù)據(jù),并反饋到廣州超算中心,通過中心強大的計算后臺,定期將用戶數(shù)據(jù)和已確診病患的數(shù)據(jù)進(jìn)行時空匹配度對比,這樣,就可以實時評估、反饋用戶的感染風(fēng)險,并且提醒用戶進(jìn)行自我隔離或主動就醫(yī),從而幫助阻斷病毒傳染?!?
診斷:標(biāo)注可疑區(qū)域輔助精確診斷
記者了解到,除助力藥物篩選、研制戰(zhàn)“疫”“彈藥”,超算中心還和中山大學(xué)附屬醫(yī)院合作,緊急開發(fā)了一套新冠病毒肺炎CT影像智能診斷平臺。
之所以是緊急研發(fā),是因為這個平臺是拿來“救急的”。超算中心負(fù)責(zé)人昨日告訴記者,在疫情暴發(fā)的初期,全國疑似病例迅速增加,湖北省的情況尤其嚴(yán)重。“但一位專業(yè)醫(yī)生在一天內(nèi)只能診斷70多個病人,在疫情重災(zāi)區(qū)是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的?!?
因此,在拿到第一手新型冠狀病毒肺炎CT影像數(shù)據(jù)后,廣州超算中心緊急組織了醫(yī)學(xué)圖像智能診斷小組,與中山大學(xué)附屬醫(yī)院的專業(yè)醫(yī)生合作,僅用一天的時間就開發(fā)出了初步診斷模型,并部署到超算平臺上進(jìn)行模型調(diào)優(yōu)和測試優(yōu)化,成功搭建了基于超算的新型冠狀病毒肺炎CT影像智能診斷平臺。
據(jù)悉,這個平臺能夠在高檢測精度下,平均15秒完成一個病人的CT圖像診斷。醫(yī)生僅需將病人的CT圖像批量打包上傳到平臺上,即可在短時間內(nèi)得到全部影像的智能診斷結(jié)果,平臺還會將CT圖像中的可疑區(qū)域標(biāo)注出,輔助醫(yī)生進(jìn)行精確診斷。
“天河二號”: 疫情發(fā)生前 就是醫(yī)療“老手”
在這場戰(zhàn)“疫”中,廣州超算為什么深受信賴?是實力。據(jù)悉,廣州超算中心的“天河二號”超級計算機拿下了全球超算五百強的六連冠。在廣東省、廣州市政府的支持下,廣州超算已經(jīng)成為全球應(yīng)用領(lǐng)域最廣、用戶數(shù)量最多的超算中心之一,在全球超算Dominant Sites排名上位列第五,是我國唯一進(jìn)入這個排名前十的超算中心。
該負(fù)責(zé)人告訴記者,生物醫(yī)藥、健康醫(yī)療領(lǐng)域是廣州超算中心一直以來重點發(fā)展的應(yīng)用領(lǐng)域,中心在這一領(lǐng)域投入了大量的資源、人才團(tuán)隊開展應(yīng)用研究和用戶合作,取得顯著應(yīng)用成效。
“比如,我們與國家衛(wèi)健委下屬的標(biāo)普醫(yī)學(xué)中心是長期合作單位。在疫情暴發(fā)前,我們已經(jīng)有了優(yōu)秀的應(yīng)用基礎(chǔ)、完善可靠的硬件基礎(chǔ)和軟件環(huán)境、業(yè)務(wù)熟練的人才團(tuán)隊,可以迅速開展疫情防控的相關(guān)工作,在短時間內(nèi)就取得比較好的成果?!?
- 原標(biāo)題:15秒完成一次CT圖像診斷 “天河二號”超級計算機搭建CT影像智能診斷平臺
- 責(zé)任編輯: 郭涵 
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